Netbeans por defecto omite las tildes y caracteres especiales. Para solucionar:
1. Ir a la carpeta de instalación y buscar el directorio etc
C:\Archivos de programa\NetBeans x.x\etc
2. Editar el archivo netbeans.conf agregando "-J-Dfile.encoding=UTF-8" en la línea de opciones por default del NetBeans (netbeans_default_options). El resto de opciones permanecen igual.
3. Volver a abrir Netbeans.
